细菌全基因组具有相对较小、重复序列较高、易于突变等特点，所以很必要对微生物进行全基因组测序。细菌de novo测序已取代传统方法成为研究细菌进化遗传机制，关键功能基因的重要工具。
目前，细菌全基因组测序使用三代测序可以得到0 Gap完成图；精确检测结构变异、可移动元件；获得全基因组6mA、4mC表观遗传图谱。
一、技术路线
二、生物信息分析
1. 原始数据质量评估
2. 基因组拼装组装
3. KEGG、eggNOG、GO注释
4. 系统发育树
5. 基因家族分析
6. 亚细胞定位
三、结果展示
1. 数据库使用
Refseq
eggNOG
2. 版图展示
图1.1所示，绘制细菌全基因组圈图；
图1.2所示，全基因组甲基化图谱；
